Polisen fick larmet klockan 06.44 på måndagen efter att en person som jobbar vid Slussenbygget sett en person i vattnet.
Kroppen togs upp ur vattnet av räddningstjänsten. Polisen kan inte gå in närmare på hur länge kroppen legat i vattnet, mer än att det rör sig om ”förhållandevis länge”.
Senare under måndagen hade personen identifierats, som en man i 50-årsåldern. Hans anhöriga är underrättade.
Inget brott misstänks bakom mannens död.