Mannen häktades på torsdagen, mot sitt nekande, misstänkt för fem våldtäkter, som enligt åklagaren ska ha begåtts i början av förra året.
Han häktades på sannolika skäl, vilket är den starkare misstankegraden.
Han misstänks för en sjätte – men tingsrätten ansåg att det bara fanns fog att häkta honom för fem.
Totalt handlar det om fyra patienter som anmält mannen.
– Det handlar om yngre män, säger chefsåklagare Gunnar Brodin till SVT.
Avstängd – sedan avskedad
Mannen har arbetat som läkare inom Region Uppsala men avskedades förra året.
– Personen har inte arbetat hos oss sedan vi nåddes av uppgifterna, säger Fredrik Settergren, verksamhetsområdeschef.
Region Uppsala har anmält händelserna till Inspektionen för vård och omsorg (IVO), med en sekretessmarkering för att innehållet inte ska äventyra polisutredningen.
– Det är oerhört allvarliga anklagelser som vi tar på allvar. Det råder patient- och förundersökningssekretess så jag kan inte kommentera mer än så, säger Fredrik Settergren.