Personen, som varit anställd hos Svenska kyrkan sedan 14 år tillbaka, blev för sex år sedan sjukskriven för utmattningssyndrom.
Hög arbetsbelastning, oklar arbetsorganisation och en ojämn fördelning av arbetsuppgifterna ska ha varit bidragande orsaker.
– Han drabbades av sjukdom och var heltidssjukskriven under en period, men hade kommit tillbaka i deltidsarbete när arbetsgivaren gick till uppsägning. Vision anser inte att det finns laglig grund för uppsägningen, säger Linda Olausson, förbundsjurist vid fackförbundet.
Enligt Svenska kyrkan saknade personen arbetsförmåga och kunde inte omplaceras. Vision ifrågasätter kyrkan och stämmer dem i Arbetsdomstolen.
Facket vill även att personen ska få sitt jobb tillbaka samt 145 000 kronor i skadestånd.
– Arbetsrättsliga tvister med Svenska kyrkan förekommer. Men detta är första gången i nutid som vi stämmer just Umeå pastorat, säger Linda Olausson.
SVT har sökt Svenska kyrkan, som inte vill kommentera.