På Mariaskolan förekommer det regelbundet konfessionella inslag i form av bibelläsning, bön och sånger på de dagliga obligatoriska morgonsamlingarna.

Innan eleverna går till lunch så håller läraren oftast en gemensam bordsbön och vanligen avslutas skoldagen med en gemensam bön som läraren leder.

Dessa exempel visar att skolan bryter mot skollagens bestämmelser om att undervisningen ska vara icke konfessionell och om frivillighet vid deltagande i konfessionella inslag i utbildningen, enligt Skolinspektionen. Enligt myndigheten ska undervisningen på alla skolor vara allsidig och saklig.

Mariaskolan drivs av Umeå Kristna Friskoleförening.