Hon berättar för Tidningen Ångermanland att förhållandet inleddes när hon just fyllt 15 år och vårdades för självskadebeteende. Hon skrevs ut från vårdhemmet förra året.
Institutionschef Stefan Hasselborg har också polisanmält händelsen.
– Jag har konfronterat mannen och fått bekräftat att han har haft ett förhållande med den unga flickan säger han till SVT Mittnytt.
Vemyra ungdomshem drivs av Statens institutionsstyrelse och tar emot flickor mellan 13 och 20 år med svåra psykosociala problem i kombination med psykiska störningar. På Vemyra vårdas också flickor som dömts till sluten ungdomsvård. Hemmet har sjutton vårdplatser och sextio anställda.
– När sådant här händer är det näst intill en katastrof för alla inblandade, om berättelsen stämmer har vi brustit i vår tillsyn säger Stefan Hasselborg.
Den manlige vårdaren har inte längre kvar sin tjänst på vårdhemmet.