Uppmaningarna till ärkebiskopens avgång har växt efter att utredningen släpptes förra veckan.
Bakgrunden är rapporter om att en man som arbetade som volontär för kyrkan, anklagas för att ha begått fysiska och sexuella övergrepp mot pojkar och unga män under 70- och 80-talet, rapporterar BBC.
”Efter att ha sökt Hans Majestät Konungens nådiga tillåtelse har jag beslutat att avgå som ärkebiskop av Canterbury”, säger Justin Welby i ett uttalande.
Över 100 pojkar och unga män utsatta
Mannen, som var en framstående advokat, drev sommarläger för unga kristna. Det var där han valde ut flera av dem som föll offer för övergreppen.
Över 100 personer ska ha blivit utsatta av mannen. Rapportförfattaren beskriver övergreppen som ”sexuellt motiverade och sadistiska”.
Det första larmet om mannen nådde den Engelska kyrkan redan i början av 1980-talet. Utredningen slår fast att Justin Welby hade kännedom om övergreppen 2013, men han larmade aldrig officiellt myndigheter.
Polisen startade utredning flera år senare
Det var inte förrän flera år senare polisen startade en fullständig utredning, efter att brittiska Channel 4 släppte en dokumentär om övergreppen.
”Jag hoppas att detta beslut tydliggör hur allvarligt den Engelska kyrkan ser på behovet av förändring och vårt djupa engagemang för att skapa en säkrare kyrka”, säger Justin Welby i uttalandet.
Mannen som anklagades för övergreppen gick bort 2018.