I ett uttalande säger Varoufakis att han förstått att representanter för eurozonen ”ser honom som ovälkommen” vid finansministermöten, och att premiärminister Alexis Tsipras bedömt att det skulle bli lättare att nå en uppgörelse om Varoufakis avgår.
”Av detta skäl lämnar jag finansministeriet i dag”, avslutar han sitt uttalande.
På sin blogg skriver Varoufakis att han fortsatt står helt bakom Tsipras, den kommande finansministern och regeringen.
Var starkt kritisk mot lånekrav
Varoufakis har gjort sig känd som en av de skarpaste kritikerna av de internationella långivarnas krav, med flera uppmärksammade uttalanden där han bland annat anklagat den så kallade trojkan för att ägna sig åt terrorism, och en av dem som hårdast drivit nej-linjen inför gårdagens folkomröstning.
”Jag ska bära långivarnas avsky med stolthet” skriver Varoufakis också.
Ny tysktalande finansminister
Euklidis Tsakalotos, som nu tillträder som finansminister, har sedan april varit huvudansvarig för förhandlingarna med långivarna. Han föddes i Nederländerna, är utbildad i Storbritannien och talar flytande tyska vilket förutspås göra honom lämplig i kommunikationen med Tyskland.
Greklandskrisen: Detta händer nu
- tisdag klockan 13: Eurozonens finansministrar möts i Bryssel
- tisdag klockan 18: Eurozonens stats- och regeringschefer samlas
- 20:e juli: Grekland ska göra återbetalning av skuld till ECB på 4,2 miljarder euro