Yoon står åtalad för att ha lett ett försök till statskupp efter att hans försök att utlysa undantagstillstånd i december misslyckats. På torsdagen närvarade den 64-årige Yoon personligen i rätten när huvudförhandlingen inleddes med de första förhören.
Han är den första sittande presidenten i landets historia att åtalas i ett brottmål. Yoon nekar till anklagelserna och hävdar att undantagstillståndet var legitimt.
Hans advokater menar att utredningen mot honom saknar grund och att han, som statschef, hade rätt att utropa krigslagar.
Barrikerade sig i palatset
Yoon har suttit fängslad sedan han greps i en stor polisinsats den 15 januari efter att ha vägrat inställa sig hos utredare och i stället barrikaderat sig i presidentpalatset.
Parallellt med brottmålet pågår även en riksrättsprocess. Landets konstitutionsdomstol ska avgöra om Yoon formellt ska avsättas från ämbetet. Om han avsätts måste ett nytt presidentval hållas inom 60 dagar.