Den förre världsettan, som åter hade problem med hettan och blev undersökt av sjukvårdspersonal, slog Joao Sousa med 6-3,6-4,6-3.
Serben var beslutsam i slutet och bröt fram till 5-3 blankt efter att plockat fram flera fina passerslag.
”Måste bara se till att överleva”
– Ibland måste man bara se till att överleva, jag är inte 21 längre, säger Djokovic enligt BBC. Han ska ha haft problem med en förkylning också.
Det var tveksamt om han skulle se Federers match mot John Millman.
– Vi får försöka att lägga barnen först. Det är prioritet nummer 1 i familjen. Om jag får tid kommer jag att titta på den matchen.