Den svenske anfallaren satte sig, av än så länge okänd anledning, i gräset på St James' Park. Sedan lade sig Alexander Isak ner och Newcastles fysioterapeut kände efter på Isaks högra ben.
– Det är ett hårt slag för oss att tappa Isak. säger Eddie Howe enligt Sky Sports.
Isak byttes ut och ersattes av Callum Wilson i matchen som Dortmund vann med 1-0. Felix Nmecha blev matchvinnare för gästerna.
– Vi hoppas att det inte är för allvarligt. Han kommer att undersökas de närmaste dagarna, säger Howe till Viaplay.
Alexander Isak hoppade in med tjugo minuter kvar i helgens ligaseger mot Crystal Palace. Tidigare i oktober lämnade Isak Blågults landslagssamling på grund av en skadekänning, och missade både träningslandskampen mot Moldavien och den avbrutna EM-kvalmatchen mot Belgien.