Inhopparen löpte mellan Romas försvarare, fick ett delikat instick från Gonzalo Higuain och med ett tillslag skickade han in avgörande 2–1-målet bakom den svenske landslagsmålvakten Robin Olsen som blivit rundad av argentinaren.
Dessförinnan hade Franck Kessie – efter fint förarbete av Ricardo Rodriguez – gett Milan ledningen i 40:e minuten. 19 minuter senare tog Romas mittback Federico Fazio vara på Davide Calabrias misslyckade rensning och ordnade kvitteringen.
Milan och Roma hade sedan varsitt mål som dömdes bort efter att domaren Marco Guida använt sig av videodomarsystemet VAR, men Patrick Cutrones fullträff i 95:e minuten godkändes och Milan fick säsongens första trepoängare i ligaspelet.
Förlusten innebär att Roma fått en mardrömsstart i ligan.