Matchen skulle ha spelats utan publik, men på bilder som nyhetsbyrån AP har tagit del av syns det att supportrar till hemmalaget tagit sig till läktarens övre delar och därifrån riktat flera nedsättande kommentarer mot svensken.
Zlatan Ibrahimovic var med i matchtruppen men vilades och fick från läktaren se sitt Milan tappa till 2-2 i slutminuterna.
– Vi har gjort allt vi kan för att organisationen kring matchen ska hålla samma höga nivå som lagen och vi kommer inte tillåtta att en ensam primitiv person befläckar vårt land och vårt folks välkomnande tradition, skriver klubben.
Förolämpningarna ska ha varit av den karaktär som används nedlåtande mot muslimer av bosnisk härkomst.
Den 39-årige svensken har sina rötter i både Bosnien och Kroatien.
Serbiska Röda Stjärnan uppger att de kommer att straffa den individ som hörs i det klippet.
KLIPP: Zlatan nådde milstolpe – 500:e klubblagsmålet (7 februari 2021)