Márquez anklagas för att han ska ha ekonomiska förbindelser med en misstänkt knarklangare med koppling till knarkkarteller i Sinaloa och Jalisco.
-Jag nekar kategoriskt till att jag har någon som helst form av relation med nämnda organisation, eller till de påstådda händelserna, säger Márquez, som frivilligt tagit kontakt med mexikanska justitiedepartementet, i ett uttalande.
Målvakt åt knarkkartell
Márquez är en av 21 personer på finansdepartementets sanktionslista i relation till knarkkartellen som kontrolleras av Raul Flores Hernandez. Fotbollsspelaren anklagas bland annat för att ha agerat så kallad målvakt åt knarkkartellen och gömt tillgångar.
38-årige Rafael Márquez är fortfarande aktiv i landslaget och spelade Confederations Cup för Mexiko tidigare i somras. Han spelar numera sin klubbfotboll i hemlandet, för laget Atlas från Guadalajara.