32-åringen anklagade Conmebol för korruption efter att han utvisades i bronsmatchen mot Chile i Copa América tidigare i sommar.
I matchen, som Argentina vann med 2–1, blev han utvisad i slutet av första halvlek efter ett bråk med en motspelare, ett domarbeslut som blev hårt kritiserat, och efteråt kunde Messi inte hålla tillbaka ilskan utan anklagade direkt Conmebol för korruption.
– Korruption och domarna gör att publiken inte kan njuta av fotbollen och förstör det hela lite. Jag hoppas att VAR och domarna inte blir avgörande i finalen, sade han.
Argentinska La Nación beskriver straffet som i det närmaste betydelselöst, eftersom han bara missar fyra vänskapsmatcher i höst.