Två av de tre sista målen kom från inhopparen Lazar Randelovic som byttes in med kvarten kvar och gjorde 2–0 i 75:e och 3–0 i 85:e minuten. Miguel Angel Guerrero hade gett grekerna ledningen med 1–0 efter en halvtimme.
Marcus Berg hade ett bra läge vid 0–1-underläge, men hans skott gick precis utanför. Berg byttes ut i 69:e minuten medan Kristoffer Olsson började på bänken, men byttes in redan efter 25 minuter efter en skada. Viktor Claesson är fortfarande borta efter knäskadan han ådrog sig i Sveriges EM-kvalmöte med Spanien i Madrid.
Norska Rosenborg har också ett tufft läge efter 0–2-förlust borta mot Dinamo Zagreb.
Segrarna i playoffomgången tar sig in i gruppspelet i Champions League medan förlorarna får trösta sig med gruppspel i Europa League.