Omanyala innehar årets tredje snabbaste tid på 100 meter (9,85) och kenyanen satte i fjol nytt afrikanskt rekord med tiden 9,77.
Försöken på herrarnas 100 meter inleds redan på fredag.
Till Kenyans.co.ke säger sprintstjärnan att den amerikanska ambassaden upptäckt ett problem med hans resedokument.
– Ambassaden har fortfarande inte kommunicerat, trots att loppet är om två dagar, säger han.
Den här säsongen är det bara amerikanerna Fred Kerley (9,76) och Trayvon Bromell (9,81) som sprungit snabbare än Omanyala på 100 meter.
Friidrotts-VM i Eugene avgörs mellan den 15 och 24 juli.
KLIPP: Daniel Ståhl om tränarens sjukskrivning