Den dubble världsmästaren i rallycross körde in hela 50 poäng i de tre heaten på Suzukabanan.
Säsongens andra seger kom efter en stenhård kamp med portugisen Tiago Monteiro. Kristoffersson, tävlandes för Sébastien Loebs Volkswagen-team, stod i pole position och vann till slut med tre sekunders marginal.
– Kul att kunna vinna på en sådan häftig bana och stort tack till teamet för en perfekt bil, säger Kristoffersson till SVT Sport.
Även Thed Björk hade en lyckad helg på Suzuka. Fyra som bäst för Björk som kör för Cyan Racing Lynk & Co. Han är trea i tabellen inför de två avslutande deltävlingarna.