Det är en förbättring med exakt tre sekunder från 2017. På inledande 500 meter hade van der Poel 38,19 och var med det 19:e av 20 åkare. Norrmannen Sverre Lunde Pedersen vann på 36,25.
De åtta främsta på 5 000 meter kvalar in till söndagens 10 000 meter, den distans som 24-åringen hoppas mest på, och där han har imponerat stort i vinter.
I morgon avgörs 1500 och 10000 meter.
Världsrekordet på 5000 meter lyder på 6.01,86 och innehas av kanadensaren Ted-Jan Bloemen, som noterade tiden 2017.