Soldaternas nationalitet har inte offentliggjorts.
– Svenskar ska inte vara inblandade alls, säger Philip Simon, presstalesperson vid Försvarsmakten, till TT.
– Jag har inga detaljer om vad som har hänt, men vi håller på att kika på det här nu, lägger han till.
I norra Mali finns cirka 250 svenska soldater i ett underrättelseförband.
Tillförordnade chefen för FN-missionen Minusma i Mali, Koen Davidse, fördömer i ett uttalande dådet som han anser är ägnat att destabilisera landet och skada fredsprocessen.