Efter it-skandalen på myndigheten fick Maria Ågren ett strafföreläggande för vårdslöshet med hemlig uppgift, ett brott som hon därmed erkände sig skyldig till. Straffet blev 70.000 kronor i böter.

När Maria Ågren även avskedades från sin tjänst som generaldirektör i regeringskansliet stämde Sveriges Ingenjörer staten. Där krävs bland annat skadestånd.

Av stämningsansökan framgår att Maria Ågren nu förnekar brott; att godkänna strafföreläggandet ska bara ha varit ett sätt att slippa den publicitet som en brottmålsrättegång skulle ha medfört.