Larmet kom till polisen klockan 02.19 natten mot onsdagen.
Polisen ryckte ut med ett stort antal patruller i jakt på taxibilen. Enligt uppgifter till SVT ska de ha stoppat minst en annan taxibil innan de påträffade den de sökte efter norr om Stockholm. Där greps föraren klockan 02.45.
– När vi fick tag på de inblandade inledde vi en förundersökning om våldtäkt, säger Fredrik Andersson, vakthavande befäl på polisen.
Målsägaren är en kvinna. Hon har tagits till sjukhus för kontroll.
Taxichauffören, en man i 30-årsåldern, arbetar inte för något av de större taxibolagen. Han anhölls av åklagare under onsdagsförmiddagen, enligt polisen.