En av dem är misstänkt för förberedelse till grov misshandel genom stenkastning, och den andra personen misstänks för våld mot tjänsteman och hot mot tjänsteman.
Enligt polisens presstalesperson Magnus Jansson Klarin finns inga uppgifter om att någon ska ha kommit till skada i samband med mötet.
– I stort sett gick det lugnt till, men det fanns en del störningsmoment – under kortare perioder, säger han.
Tågen stoppades
En man som gick upp på tågspåret intill mötesplatsen avlägsnades av polisen. Det är oklart om mannen är misstänkt för något brott. Tågtrafiken norr om Uppsala stoppades under en kortare period.
Polisen har under veckan arbetat förebyggande och uppsökande inför Rasmus Paludans besök.
– Man har varit ute i flera områden i Uppsala och pratat med folk, för att det inte skulle bli några våldsamheter i samband med mötet, säger Magnus Jansson Klarin.
Organisationen Flamman från Malmö deltog vid Paludans möte, och tackas särskilt av Uppsalapolisen för det.
”Höll inte häktningsskäl”
På söndagen berättade polisen att de gripna personerna nu inte längre är frihetsberhövade.
– Ingen sitter anhållen sen igår. Gripandet var rätt, men det höll inte häktningsskäl, säger Odd Von Helreich, jourhavande förundersökningsledare Uppsalapolisen.
I klippet nedan: Rafi Farouq från Flamman berättar om organisationens arbete i Uppsala.