Båda männen är utländska medborgare i 60- eller 70-årsåldern, enligt kammaråklagare Maria Thorell.
Den misstänkte är begärd häktad på sannolika skäl misstänkt för mord, vilket är den starkare graden av misstanke. Häktningsförhandlingen sker på söndagsförmiddagen.
Thorell vill inte säga om den avlidne mannen redan var död när hamnade i vattnet, eller om personerna som slog larm har kunnat ge viktiga vittnesuppgifter.
Båten som männen färdades med, en trimaran, har tagits i beslag av polisen.