Diskussionen ska bland annat berört frågan om att skapa en gemensam arbetsgrupp för att utreda fallet.
En saudisk delegation uppges redan ha rest till Turkiet som en del i undersökningen.
Khashoggi har varit försvunnen sedan han besökte saudiska konsulatet i Istanbul. Turkiska myndigheter tror att han mördades därinne, vilket förnekas av Saudiarabien.