Under ett svårt och komplicerat bärgningsarbete söker räddningsarbetare efter offer vid det kraschade tåget.
Hittills har fem dödsoffer påträffats bland de omkullvälta vagnarna. Samtidigt som mellan sju och fjorton personer ännu saknas, uppger polisen för Der Spiegel. Enligt polisen är också 44 personer skadade efter olyckan.
Regionaltåget var på väg norrut från Garmisch-Partenkirchen till München när flera vagnar av oklar anledning spårade ur vid lunchtid på fredagen. Bland passagerarna ska det ha funnits många barn, enligt tv-kanalen BR.
Begärt en lyftkran
Flera av tågets tvåvåningsvagnar ligger omkullvälta på sidan av spåret och räddningsarbetare fick klättra in i tåget med hjälp av stegar för att undsätta personer som befunnit sig därinne.
Sent på kvällen ska också en enorm lyftkran ha begärts från München, som ska kunna lyfta borta vagnarna.
Det är ännu oklart hur olyckan kunde ske, men utredarna bedömer i nuläget att det inte rör sig om ett sabotage, säger Bayerns inrikesminister Joachim Herrmann.