Flygplanet försvann från radarn efter att ha lämnat landets huvudstad Lilongwe, uppger presidenten Lazarus Chakweras kansli på måndagen.
Planet skulle landa på Mzuzu International Airport i norra Malawi på förmiddagen. En sök- och räddningsoperation inleddes när det inte gick att kontakta flygplanet.
Sökinsatsen tog över en dag och flygplanet lokaliserades i bergen i de norra delarna av landet. Ingen ombord var vid livet när det anträffades, säger presidenten.
Vad som förorsakat kraschen är i nuläget okänt.