”Al-Quds-brigaderna sörjer ledaren Khaled Mansour, medlem av säkerhetsrådet och befälhavare för den södra regionen, som blev martyr till följd av en israelisk flygattack i går”, skriver gruppen i ett uttalande enligt nyhetsbyrån Reuters.
Al-Quds-brigaderna är Islamiska Jihads väpnade gren.
Befälhavaren i den norra delen av Gazaremsan, Taysir Jabari, dödades i en annan flygräd i fredags eftermiddag.
Värsta våldsutbrottet på mer än ett år
Palestinska myndigheter uppger att 29 personer har dödats sedan attackerna inleddes i fredags, varav sex barn. Åtminstone 253 personer uppges ha skadats, enligt AP.
Israel uppger att attackerna syftar till att undanröja ett konkret och överhängande hot från Islamiska Jihad mot israeler i området närmast Gazaremsan. Israel uppskattar att flygattackerna har dödat omkring 15 militanta palestinier. De israeliska myndigheterna uppger att ett 20-tal misstänkta medlemmar av gruppen på Västbanken har gripits.
Islamiska Jihad har svarat med att skjuta hundratals raketer mot Israel, dock utan att göra någon större skada. Rörelsen är terroriststämplad av EU och USA, liksom den större Hamasrörelsen.
Hamas, som styr på Gazaremsan, håller sig än så länge utanför den senaste konflikten.