Den förra varningen, som gick ut den 7 december, var den allra första av det slaget.
Myndigheterna varnar för att Peking kommer att höljas i kraftiga föroreningar från lördag till tisdag. Den högsta hotnivån kan leda till att skolor stängs och att bilanvändande begränsas.
Efter årtionden av stark ekonomisk tillväxt har Kinas ledning lovat att slå ner på de höga nivåerna av luft-, vatten- och jordföroreningarna, och även den täta smog som ligger över många större städer.