Runt 20 av de dokumenterade offren var under fem år, enligt Unicef. I minst fyra fall har spädbarn våldtagits.
Förövarna uppges vara beväpnade soldater och milismän och övergreppen har skett på flera olika håll i landet. Många av våldtäkterna var konfliktrelaterade, enligt Unicef som konstaterar att sexuellt våld används som vapen i det krigshärjade Sudan.
Mörkertalet antas dessutom vara stort, dels på grund av svåra stigman och dels på grund av raserade samhällstjänster.
– Det är bara toppen av isberget. Det finns utan tvekan ytterligare hundratals barn som har våldtagits, säger FN-organets talesperson Tess Ingram.
Traumat slutar inte när övergreppet är över. Många som Ingram mött har allvarliga psykiska ärr, säger hon – däribland flera som berättat hur de försökt begå självmord och en flicka som fått flera slaganfall till följd av våldtäkten.
Enligt människorättsorganisationer begås övergreppen av bägge sidor i det krig som plågat Sudan sedan april 2023, då strider mellan landets armé och paramilitära RSF bröt ut. Sedan dess har minst 20 000 människor dödats och över 14 miljoner har tvingats lämna sina hem. Delar av landet lider svår hungersnöd.
Fakta: Kriget i Sudan
Kriget i Sudan bröt ut i april 2023, då det uppstod splittring inom en militärjunta som hade tagit makten ett par år efter den mångårige diktatorn Omar al-Bashirs fall.
På ena sidan står general Abd al-Fattah al-Burhan, som för befäl över armén, och på den andra hans tidigare ställföreträdare Mohamed Hamdan Dagalo som leder den så kallade RSF-milisen.
Tiotusentals människor har dödats i kriget. Fler än 14 miljoner människor har drivits på flykt.
Båda parter har upprepade gånger anklagats för krigsbrott.
RSF har sitt ursprung i de ökända janjawadmiliserna, som under al-Bashirs styre skickades ut för att sprida skräck och slå ned upproret i Darfur i västra Sudan i början av 2000-talet.