46-åringen stred på rebellsidan i Syrien. I maj 2012 befann sig han och hans grupp nära Idlib i nordvästra Syrien.
I september 2013 publicerade New York Times en film där rebellgruppen skjuter ihjäl sju bakbundna män.
Mannen anhölls i sin frånvaro i mars i år och greps kort därefter. På torsdagen åtalas 46-åringen.
– Åtalet gäller folkrättsbrott, grovt brott, alternativt mord, säger åklagaren Kristina Lindhoff Carleson vid internationella åklagarkammaren till Expressen.