Söndagens marsch för att kräva en övergång till civilt styre var den första stora manifestationen sedan den 3 juni, då över 100 demonstranter uppges ha dödats av soldater.
Enligt en läkarorganisation allierad med proteströrelsen krävdes fem dödsoffer. Uppgifterna om sju döda kom från hälsovårdsdepartementet.
”På sjukhus i huvudstaden och i provinserna finns det flera som är allvarligt skadade av militärrådets milisers kulor”, uppger läkarrådet enligt nyhetsbyrån AFP.
Mohamed Hamdan Dagalo, vice chef i Sudans militärråd och RSF-milisens befälhavare, sa i statlig tv att okända prickskyttar har skjutit fem eller sex civila och tre paramilitära soldater i Khartum, rapporterar Reuters.
– Prickskyttarna som skjuter på människor kommer att ställas inför rätta, sa Dagalo, utan att precisera ifall någon av de skjutna dött.
Stor protest
Under söndagseftermiddagen tågade tusentals mot presidentpalatset i Khartum. Polisen sköt tårgas mot demonstranter, uppger nyhetsbyrån AFP:s korrespondent. Och enligt vittnen har polisen avlossat skott i luften när demonstranterna tog sig mot försvarsdepartementet.
Över 120 människor ska ha dödats den 3 juni och i ytterligare attacker under dagarna som följde, enligt en läkarorganisation lojal med proteströrelsen.