Khalid Sheikh Mohammed ska erkänna brottet för att få livstids fängelse istället för dödsstraff. USA:s försvarsdepartement Pentagon skriver i ett pressmeddelande att uppgörelsen också gäller två medhjälpare, Walid bin-Attash och Mustafa al-Hawsawi.
Männen har varit frihetsberövade sedan 2003, och befunnit sig på det ökända fånglägret i Guantanamo Bay sedan 2006.
Anhöriga till terroroffer: Äntligen
Bland offren till Elfte septemberattackerna har åsikterna gått isär om vad som borde hända med de långa domstolsprocesserna i fallet.
– Min första reaktion är: Äntligen. Det har hållit på så länge. Men nu väntar jag på att få mer information om processen framåt, säger Aidan Salamone, vars pappa dödades i attackerna 2001, till SVT.
Låg bakom idén
Khalid Sheikh Mohammed anses vara den som kom på idén om att kapa flygplan och flyga in dem i byggnader. En idé han sedan presenterade för Osama bin Laden 1996. Han ska även ha hjälpt till med att träna några av flygplanskaparna.
Mohammed och al-Hawsawi greps i Pakistan 2003 och hölls först i hemliga CIA-fängelser innan de förflyttades till Guatanamo år 2006. Där ska Mohammed ha utsatts för skendränkning 183 gånger, enligt en rapport till USA:s kongress.