De materiella skadorna i den nordvästra provinsen Esmeraldas rapporteras vara omfattande och minst 700 familjer har tvingats att lämna sina hem.
De avlidna dog alla av hjärtattack, enligt landets president Rafael Correa, som har åkt till det drabbade området.
Provinsen drabbades av strömavbrott, som nu åtgärdats, och skolorna hålls stängda.
Det sydamerikanska landet återhämtar sig fortfarande efter den förödande jordbävningen med magnituden 7,8 som skakade landet i april, då 673 människor dog och 6 000 skadades.