Han anklagas bland annat för att ha finansierat extremistisk verksamhet, offentligt hetsat till extremistisk verksamhet och för att ”rehabilitera den nazistiska ideologin”.
47-årige Navalnyj sitter redan fängslad efter tidigare domar, som fallit sedan Ryssland intensifierat jakten på oliktänkande i samband med storinvasionen av Ukraina.
Enligt Navalnyjs medhjälpare ska domen mot honom falla den 4 augusti.
Rättegången har hållits bakom stängda dörrar på högsäkerhetsfängelset IK-6 där Navalnyj hålls fängslad.
Navalnyj fördömde Rysslands krig mot Ukraina
Under en domstolsförhandling under torsdagen ska oppositionsledaren också ha fördömt Rysslands anfallskrig mot Ukraina.
Ryssland ”badar i en pöl av antingen lera eller blod, med brutna ben, med en fattig och berövad befolkning, och runt den ligger tiotusentals människor dödade i 2000-talets mest korkade och meningslösa krig”, ska Navalnyj ha sagt under förhöret, enligt ett uttalande från hans medhjälpare.