Enligt en talesperson för Sri Lankas militär hördes en explosion under sökinsatsen vid en misstänkt bombfabrik och när polisen kom till platsen blev de beskjutna. Det finns ännu inga uppgifter om att någon ska ha skadats.
Enligt lokala medier tros bombvästar ha tillverkats på den aktuella platsen.
Polisen söker efter 140 personer som misstänks ha kopplingar till terrororganisationen IS och påskdagens självmordsdåd mot kyrkor och hotell runtom i landet. Hittills har 70 misstänkta gripits, bland dem egyptiska och syriska medborgare.
Mässor inställda
Omkring 250 människor miste livet och 500 skadades på påsksöndagen. Denna söndag har katolska mässor i hela landet ställts in av rädsla för ytterligare attentat.
IS har sagt sig ligga bakom attentatet, men det har ännu inte kunnat bevisas. Lankesiska myndigheter säger att det är nio personer som genomfört dåden, åtta män och en kvinna.