Piloten genomförde vad som beskrivs som ett rutinuppdrag, rapporterar CNN och andra amerikanska medier och hänvisar till ett uttalande av amerikanska marinen.
Piloten uppges ha skjutit ut sig på ett säkert sätt och räddades av en militär helikopter.
Pilotens hälsotillstånd beskriv som stabilt. Ytterligare sex personer skadades i besättningen på hangarfartyget USS Vinson.
Misstag vid landning
Orsaken till olyckan är under utredning, men beskrivs som ”ett misstag vid inflygning”. Hangarfartyget USS Carl Vinson uppges fungera normalt efter olyckan, men det havererade stridsflygplanet ska bärgas. Fartyget drivs delvis av atomreaktorer.
Flygplanskraschen beskrivs som den första kända i sitt slag för Lockheed Martins nya stridsflygplan F-35C som är konstruerat för att utföra uppdrag från marinens hangarfartyg.
Modellen F-35A används av flygvapnet och lyfter och landar på vanliga landningsbanor.
Flygplanstypen används av USA och åtta andra länder. Ytterligare sex länder har beställt F-35. Finland meddelade nyligen att de beställer F-35 av USA – en order värd omkring 100 miljarder kronor.